PDB файл гэж юу вэ?

PDB файлыг хэрхэн нээж, засах, хөрвүүлэх вэ

PDB файлын өргөтгөл бүхий файл нь програм эсвэл модулийн тухай мэдээллийг DLL эсвэл EXE файл зэрэг дибаг хийх мэдээллийг агуулдаг програмын мэдээллийн сангийн форматаар үүсгэгдсэн файл юм. Тэдгээрийг заримдаа бэлгэ тэмдэг файл гэж нэрлэдэг.

PDB файлууд нь төрөл бүрийн бүрэлдэхүүн хэсгүүд, мэдэгдлүүдийг эх кодод хөрвүүлсэн бүтээгдэхүүнийг газрын зураг дээр дибаг хийх боломжтой. Энэ нь дибаг хийгчийг эх файл болон байрлах дибаг хийх процессийг байршуулахын тулд ашигладаг.

Зарим PDB файлууд нь Protein Data Bank файлын форматтай байж болох юм. Эдгээр PDB файлууд нь уургийн бүтэцтэй холбоотой координуудыг хадгалж байдаг цэвэр текст файл юм.

Бусад PDB файлууд нь Palm Palm буюу PalmDOC файлын форматад үүссэн бөгөөд PalmOS гар утасны үйлдлийн системд ашиглагддаг . Энэ форматын зарим файлууд .PRC файлын өргөтгөлийг ашиглана.

PDB файлыг хэрхэн нээх

Өөр өөр програмууд нь өгөгдлийн санг хэлбэрээр хадгалахын тулд өөрсдийн PDB файлыг ашигладаг бөгөөд програм бүр нь өөрийн төрлийн PDB файлыг нээхэд ашигладаг. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio, болон Pegasus нар нь PDB файлыг мэдээллийн баазын файл болгон ашиглаж болох програмуудын цөөн хэдэн жишээ юм. Радара ба PDBparse нь PDB файлуудыг нээхэд ашигладаг.

Зарим PDB файлууд Geneious 'Program Debug Database файлууд шиг цэвэр текст маягаар хадгалагддаг бөгөөд текст засварлагч дээр нээгдсэн тохиолдолд уншигдах боломжтой. Та энэ төрлийн PDB файлыг Windows дээр суулгагдсан Notepad програмын нэгэн адил текстэн баримтыг уншиж чадах ямар ч програмыг нээж болно. Зарим бусад PDB файлын үзүүлэгчид болон редакторуудад Notepad ++ болон Brackets зэрэг орно.

Бусад PDB өгөгдлийн сангийн файлууд нь текст баримт бичиг биш бөгөөд зөвхөн зориулалтын програмаар нээгдэхэд зөвхөн ашигтай байдаг. Жишээлбэл, хэрэв таны PDB файл Quicken -д ямар нэг байдлаар холбоотой бол, дараа нь тухайн програмыг ашиглан PDB файлыг харах буюу засахын тулд ашиглана уу. Visual Studio нь DLL эсвэл EXE файлтай ижил фолдерт PDB файлыг үзэхийг хүсч байна.

Та протейн өгөгдлийн банкны файлууд болох Windows, Linux, болон MacOS дээр AVG файлуудыг үзэж, засах боломжтой. Jmol, RasMol, QuickPDB, болон USCF Chimera нь PDB файлыг нээж чадна. Эдгээр файлууд нь энгийн текст учраас та текст засварлагч дээр PDB файлыг нээж болно.

Palm Desktop нь Palm Database форматтай файлын форматтай PDB файлуудыг нээх боломжтой боловч эхнийх нь тухайн програмд ​​зориулж .PRC файлын өргөтгөлтэй байх ёстой. PalmDOC PDB файлыг нээхийн тулд STDU Viewer-г оролдоорой.

PDB файлыг хэрхэн хувиргах вэ

Хөтөлбөрийн Өгөгдлийн сангийн файлууд нь файлын хөрвүүлэгч хэрэгсэлтэй наад зах нь файлын формат уруу хөрвүүлэгдэхгүй байх магадлалтай. Үүний оронд, энэ төрлийн PDB файлыг хувиргах ямар нэгэн хэрэгсэл байдаг бол энэ нь үүнийг нээж чадах ижил програм байх болно.

Жишээлбэл, хэрэв та Quicken-аас өөрийн PDB өгөгдлийн файлын файлыг хөрвүүлэх шаардлагатай бол үүнийг хийх програмыг ашиглана уу. Гэхдээ энэ төрлийн хөрвүүлэлт нь эдгээр хэрэглээний програмуудад хэрэглэгдэхгүй бөгөөд энэ төрлийн өгөгдлийн санг дэмждэггүй байж магадгүй (өөрөөр хэлбэл энэ төрлийн PDB файлыг бусад формат руу хөрвүүлэх шаардлагагүй байж магадгүй).

Protein Data Bank файл MeshLab-тай бусад форматтай хөрвүүлж болно. Үүнийг хийхийн тулд та PDM файлыг WRL-д PyMOL файлаар файлын> Save Image As> VRML цэснээс хөрвүүлж дараа нь MeshLab-д WRL файлыг импортлон, File> Export Mesh As цэсийг ашиглан төгсгөлд нь PDB STL эсвэл өөр файлын формат руу файлыг оруулах.

Хэрэв танд загвар хэрэгтэй биш бол, та шууд PDB файлыг USCF Chimera-тай шууд STL (татаж авах холбоос дээр байгаа) экспортлох боломжтой. Үгүй бол та дээрхтэй адил аргыг (MeshLab ашиглан) WB файлыг USCF Chimera ашиглан хөрвүүлэх, дараа нь WRL файлыг MeshLab ашиглан STL уруу экспортолж болно.

Хэрэв та PalmDOC файлтай бол PDB-ийг PDF эсвэл EPUB болгон хөрвүүлэхийн тулд хэд хэдэн арга байж болох ч хамгийн хялбар нь Zamzar шиг онлайн PDB хөрвүүлэгч ашиглах боломжтой байж магадгүй юм. Та эдгээр вэбсайт руу PDB файлаа байршуулж, AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT болон бусад э-майл форматын хэлбэрт хөрвүүлэх боломжтой болно.

PDB файлыг FASTA формат руу хөрвүүлэхийн тулд Meiler Lab-ийн онлайн PDB FASTA хөрвүүлэгчийг ашиглан хийж болно.

Мөн PDBx / mmCIF ашиглан PDB-ийг CIF (Crystallographic Information format) онлайн болгож хөрвүүлэх боломжтой.

PDB файлууд дээр дэвшилтэт унших

Та Microsoft, GitHub, and Wintellect програмын мэдээллийн сангийн файлуудын талаар илүү ихийг уншиж болно.

Протеиний мэдээллийн банкны файлуудын талаар илүү их мэдээлэл авах болно. Дэлхий даяар Protein Data Bank болон RCSB PDB-г харна уу.

Таны файл нээгээгүй байна уу?

Дээрх хэрэгслийг нээхгүй байгаа PDB файлууд нь яг үнэндээ PDB файл биш юм. Юу болж магадгүй юм бол та файлын өргөтгөлийг уншиж байгаа нь буруу байна; зарим файлын хэлбэршилтүүд нь "PDB" -тэй төстэй дагаварыг ашигладаг бөгөөд тэдгээр нь хоорондоо уялдаа холбоогүй, мөн адил ажилладаггүй.

Жишээ нь, PDF файл нь баримтын файл боловч дээрх програмуудаас ихэнх програмууд нь эдгээр програмын програмуудыг нээхийг оролдох үед текст болон / эсвэл дүрсийг зөв үзүүлэхгүй. Үүнтэй төстэй бичигдсэн файлуудыг PD, PDE, PDC, PDO файл зэрэг бусад файлуудад мөн адил хэрэглэнэ.

PBD нь EaseUS Todo Backup программд харьяалагдах өөр нэг хувилбар бөгөөд энэ програмаар нээгдэхэд зөвхөн ашигтай байдаг.

Хэрэв танд PDB файл байхгүй бол файлын өргөтгөлийг судалж, түүнийг нээх, хөрвүүлэх тохирох програмыг олох боломжтой болно.